Nagasaki terletak di bagian selatan Jepang, tepatnya di Pulau Kyushu. Bersama dengan Yokohama di sisi timur dan Hakodate di utara Jepang, Nagasaki menjadi pelopor perdagangan Jepang dengan luar negeri, yang kemudian memacu pertumbuhan ekonomi Jepang khususnya di wilayah selatan. Wilayah pesisir pantai dengan suhu udara yang hangat hampir sepanjang tahun adalah keistimewaan Nagasaki dibandingkan wilayah lainnya di Jepang. Namun, yang membuat Nagasaki dikenal oleh dunia adalah peristiwa bom atom di kota Nagasaki tanggal 9 Agustus 1945.
